Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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