Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms