Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NischQ80TM9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
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