Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Kcnf1Q7TSH7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnf1Q7TSH7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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