Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms