Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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