Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms