Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms