Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms