Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms