Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms