Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms