Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trak1Q6PD31 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trak1Q6PD31 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms