Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms