Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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