Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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