Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CltbQ6IRU5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms