Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Arhgap20Q6IFT4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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Arhgap20Q6IFT4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Arhgap20Q6IFT4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Arhgap20Q6IFT4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Arhgap20Q6IFT4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Arhgap20Q6IFT4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Arhgap20Q6IFT4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Arhgap20Q6IFT4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Arhgap20Q6IFT4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Arhgap20Q6IFT4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgap20Q6IFT4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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