Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TroQ6DIC6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms