Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms