Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms