Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms