Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pacsin1Q61644 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pacsin1Q61644 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms