Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms