Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms