Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb6Q60692 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms