Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms