Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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