Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tns3Q5SSZ5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms