Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sun3Q5SS91 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sun3Q5SS91 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms