Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Trappc1Q5NCF2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc1Q5NCF2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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