Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf38aQ4FK66 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf38aQ4FK66 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms