Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms