Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc9Q3V038 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc9Q3V038 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc9Q3V038 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc9Q3V038 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc9Q3V038 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc9Q3V038 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc9Q3V038 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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