Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnpc3Q3UZ01 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnpc3Q3UZ01 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms