Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms