Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd27Q3UMR0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd27Q3UMR0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd27Q3UMR0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd27Q3UMR0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd27Q3UMR0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd27Q3UMR0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ankrd27Q3UMR0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd27Q3UMR0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd27Q3UMR0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd27Q3UMR0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ankrd27Q3UMR0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ankrd27Q3UMR0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ankrd27Q3UMR0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ankrd27Q3UMR0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ankrd27Q3UMR0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ankrd27Q3UMR0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ankrd27Q3UMR0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ankrd27Q3UMR0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ankrd27Q3UMR0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ankrd27Q3UMR0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ankrd27Q3UMR0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms