Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms