Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E330014E10RikQ3UL33 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms