Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Arfgef3Q3UGY8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Arfgef3Q3UGY8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Arfgef3Q3UGY8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Arfgef3Q3UGY8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Arfgef3Q3UGY8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Arfgef3Q3UGY8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Arfgef3Q3UGY8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms