Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms