Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem109Q3UBX0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms