Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LbrQ3U9G9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
LbrQ3U9G9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms