Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms