Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hvcn1Q3U2S8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hvcn1Q3U2S8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hvcn1Q3U2S8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hvcn1Q3U2S8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hvcn1Q3U2S8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hvcn1Q3U2S8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Hvcn1Q3U2S8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Hvcn1Q3U2S8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hvcn1Q3U2S8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms