Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms