Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U1D9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms