Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms