Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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