Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pnpla6Q3TRM4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pnpla6Q3TRM4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms